2006年3月7日，尚勇副部长召开部长办公会讨论“十一五”国际科技合作计划工作部署。国际合作司靳晓明司长、姚为克副司长、孟曙光副司长、马林英副司长及张健处长等参加了会议。会上，尚勇副部长对“十一五”国际科技合作计划工作部署作了重要指示。
   尚勇副部长要求，“十一五”期间，国际科技合作计划要切实实现五个转变：
   1．从一般性的国际科技合作，向以《规划纲要》为目标、以需求为导向的国际科技合作方向转变。树立“大国际科技合作”的观念，更加紧密地围绕《规划纲要》确立的重点任务，紧密结合国家各大科技计划的需求，遴选国际科技合作的重点领域和项目，做到与各科技计划互相协同、融为一体，解决国内计划与国际合作计划“两张皮”问题。利用国际优势科技资源为国内计划实施服务，使国际科技合作成为国家自主创新体系不可或缺的重要组成部分，形成“大国际科技合作”的新格局。
   2. 从重项目合作，向重“项目-人才-基地-信息”相结合的国际科技合作方向转变。改变过去重项目合作，形成“项目－人才－基地－信息”相结合的国际科技合作新形式，注重人才培养和引进，支持国际科技合作基地的建设，搭建国际科技合作资源信息服务平台，引导科研机构和企业充分利用国际科技资源，提升自主创新能力，推动国家自主创新体系的建设。
   3. 从“引进来”为主，向“引进来”和“走出去”相结合的国际科技合作方向转变。从单纯引进技术和资金，转变为“引进来”和“走出去”相结合，鼓励有条件的企业和科研机构到海外建立研发基地，开展委托研究，充分利用全球科技资源，包括人力、资金、技术、市场等资源，促进自主创新，开拓发展空间。支持我国科学家走向国际舞台，参与国际重大科研计划和重大工程合作。
   4．从以专业外事队伍为主，向多主体共同参与、积极性得到充分发挥的国际科技合作方向转变。要充分把握国际科技合作的主体、层次、内容和方式不断变化的趋势，创新工作思路和工作方式，拓展工作渠道，搭建合作舞台，创造合作条件，提供合作环境，形成政府搭台，企业、大学、研究机构等主体作用充分发挥的国际科技合作格局。特别注重企业在国际科技合作中的主体作用，为企业利用全球科技资源，提升创新能力做好服务。
   5．从以“自下而上”为主的立项机制，向以《规划纲要》实施需求出发的“自上而下”为主的立项机制的方向转变。完善和发展“十五”期间建立的国际科技合作协调机制，加强各大主体计划间的统筹和协调，围绕《规划纲要》和主体计划、重大专项实施，以需求为导向，凝练合作重点，建立“自上而下”的渠道，根据重点领域、重点国别定向征集项目，主动广泛利用国际科技资源。加强统筹协调，实现重点突破。尚勇副部长在引进国际资源重点、经费重点、及今年经费预算安排三个方面阐述了自己的观点，同时对技术转移、走出去引进来的技术战略作了重要指示。
   对于今年的工作重点，尚勇副部长要求，布置并建设《规划纲要》所需的国际优秀人才库，为《规划纲要》的实施提供人才支撑；重点开展围绕重大项目、重大专项的国际科技合作工作，如清洁发展机制（CDM）；要加强中医药国际化合作研究计划启动工作，做好国际市场调研；在生物医药方面，要大力引进一批留学人才，积极推进天津国家生物医药国际创新园（天津）建设工作；在信息技术方面，加快济南国家信息技术国际创业园的建设工作。