2009年是全球积极应对金融和经济危机的一年。在通过了4万亿的政府投资后，又针对医疗体制改革这一民生问题，我国启动了3年高达8 500亿元的投资计划。2009年三季度开始，医药行业在甲流、基本药物目录公布、资产重组三方面因素的联合推动下，医药板块连续跑赢大盘24.7个百分点，11月16日医药指数顺利突破前期最高点，成为自大盘下跌以来最先收复失地的行业。

　　在新医改背景下，医药商业行业整合、集中提升是必然趋势，央企加速重组必将推动我国整体产业结构格局的改变，未来医药商业扩张和企业并购将双双推动行业重组迅速演化。

　　以国药集团和上药集团为先锋的医药重组大幕已经拉开，在上海市国有资产的优化布局以及建设国际金融中心的战略部署下，上药集团、上实集团重组实质性进展亦将于2010年度见分晓。

　　同时，中生集团和上海医药工业研究院（下称医工院）注入国药集团预期强烈。2009年9月16日，国药集团与中生集团联合重组，使得中国生物技术集团整体上市浮出水面。目前中生集团旗下上市公司天坛生物发布公告称，公司重组已经获证监会批准，公司更名为中国生物技术股份有限公司，寻求整体上市。有专家认为，未来国药集团可能以天坛生物为整合平台，将中生集团资产注入，打造以疫苗和血制品为核心业务的生物制药航母。

　　此外，有消息认为国药集团还可能收购医工院，并以现代制药为平台在化学药领域拓展。由此，机构将目光转向了现代制药重组。在央企重组大趋势下，现代制药作为上海医工院惟一的上市平台，面临新的机遇。2009年，现代药物制剂工程研究中心将持有的现代制药4.67%股权，在二级市场上减持至3.475%。而医工院方面称拟内部协议受让制剂中心持有的现代制药全部股份，受让价格为7.8元/股。据悉，是次受让完成后，医工院持有公司股份的比例将由38.145%增至41.62%，绝对控股现代制药。

　　有业界人士指出，在医工院并入国药集团，国药控股香港上市、中生集团注入整合完毕后，国药集团旗下将拥有国药控股、国药股份、一致药业、天坛生物和现代制药5家上市公司，成为不可撼动的巨型央企医药集团。

　　另一方面，仍存在较大不确定性的是北药集团和华润系医药资产重组。华润医药资产主要来源于重组央企华源集团、三九集团医药资源，直接或间接控股三九医药、东阿阿胶、双鹤药业、万东医疗等多家医药上市公司。北京医药集团不仅持有上市公司双鹤药业48.89%的股权以及万东医疗51.51%的股份，还持有北京赛科药业、北京紫竹药业、北医股份、中国医药研究中心、北京万东医疗装备公司、本元正阳基因技术、辽宁华源本溪制药、双鹤高科天然药物等公司。有专家认为，待北药集团控制权明晰，合并重组才会逐渐展开。

　　还有业内人士认为，上海国资委将旗下医药资产整合完毕后，北药集团也有可能上演类似整合路径，即地方国资委强势介入，华润丧失控制权。当然也不排除华润进一步增持，并获得控制权的可能性。但是，只要是北药集团的控制权得到明确，那么旗下多家公司发展都有望获得大股东更多的支持，接下来的整合重组也将是顺理成章的事了。

　　另外，华鲁集团旗下的新华制药和鲁抗医药、太极集团旗下的太极集团、西南药业和桐君阁，以及华立集团旗下的华立药业、昆明制药，都存在资产整合的要求。